26-10-2026
Sécurité de l’eau en agriculture : prévenir Cyclospora
La sécurité de l’eau en agriculture constitue un levier important pour prévenir la contamination microbiologique des aliments. Le 9 octobre 2026, l’Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture (FAO) a rappelé cet enjeu à travers une nouvelle ressource consacrée notamment à Cyclospora cayetanensis.1
Cyclospora : prévenir la contamination en amont
Cyclospora cayetanensis est un parasite protozoaire responsable de la cyclosporose. Des épidémies ont notamment été associées à des produits végétaux frais consommés crus.1,2
En 2026 les Etats-Unis ont fait face à la plus importante épidémie d’intoxication alimentaire par Cyclospora associée à de la laitue iceberg, avec plus de 13 000 cas identifiés (https://www.fda.gov/food/foodborne-pathogens/cyclospora).
Afin de répondre à la nécessité de renforcer la surveillance de ce parasite dans les légumes frais à feuilles vertes et les fruits à baies, une norme ISO est actuellement en cours d’élaboration, avec la participation d’ACTALIA, qui en assure le co-pilotage.
Selon la FAO, l’eau peut introduire des contaminants à plusieurs étapes de la production alimentaire. Cela concerne notamment la préparation des intrants agricoles, l’irrigation et certaines opérations après récolte.1
La prévention en amont prend donc une importance particulière. En effet, la FAO indique que que les lavages domestiques et industriels n’éliminent pas Cyclospora de manière fiable des produits frais contaminés et que ce parasite est résistant aux désinfectants chlorés.1
Mieux maîtriser la sécurité de l’eau
La FAO identifie plusieurs priorités : protéger les ressources en eau, adapter leur qualité à leur usage et renforcer l’hygiène et l’assainissement. Elle recommande aussi d’améliorer la détection, la traçabilité et l’investigation des épidémies.1
L’enjeu dépasse toutefois le seul cas de Cyclospora. La maîtrise de l’eau contribue également à réduire l’exposition des systèmes agroalimentaires à différents dangers microbiologiques.1
Cette approche rejoint les problématiques d’expertise d’ACTALIA en sécurité microbiologique des aliments et de l’eau. Le pôle Virologie et Parasitologie dans les Eaux et les Aliments d’ACTALIA travaille notamment sur la détection et la quantification des parasites protozoaires dans ces matrices.3
Une approche préventive pour les filières alimentaires
La publication de la FAO rappelle ainsi l’intérêt d’intégrer la qualité de l’eau dès l’amont des démarches de maîtrise sanitaire. Prévention, surveillance et connaissance des voies de contamination sont complémentaires.
Pour les professionnels de l’agroalimentaire, l’analyse des dangers liés à l’eau doit cependant rester adaptée aux usages, aux matrices et aux conditions de production. L’expertise scientifique permet alors d’identifier les méthodes de surveillance ou d’analyse pertinentes pour chaque situation.
Sources
1 FAO, 2026. Safe water, safe food: preventing contamination upstream, 9 octobre 2026 : https://www.fao.org/food-safety/news/detail/safe-water–safe-food–preventing-contamination-upstream/
2 FAO, 2026. Food safety begins upstream: What Cyclospora outbreaks remind us about food and water safety across agrifood systems : https://openknowledge.fao.org/server/api/core/bitstreams/19ff7c68-94f2-4714-bc4e-51f22868d71a/content
3 ACTALIA, Pôle Virologie et Parasitologie dans les Eaux et les Aliments ; contact : Stéphanie LA CARBONA, PhD, Directrice adjointe : s.lacarbona@actalia.eu
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