18-03-2024
Essai PCR numérique pour la quantification du virus de l’hépatite E dans les aliments
La RT-PCR quantitative en temps réel (RT-qPCR) est l’une des méthodes les plus appropriées pour la détection et la quantification des virus dans les aliments. Néanmoins, la quantification par RT-qPCR présente des limites. La Droplet digital PCR (ddPCR) permet une quantification précise des acides nucléiques et une réduction de l’effet de la présence d’inhibiteurs sur la quantification des virus.
Les objectifs du présent travail étaient (i) de développer une méthode de quantification absolue du VHE dans les tissus porcins basée sur la technologie ddPCR et de fournir un contrôle interne du processus pour l’évaluation de la récupération et (ii) d’évaluer la performance de la méthode en analysant une sélection d’échantillons naturellement contaminés, précédemment testés à l’aide de la RT-qPCR.
La méthode développée dans la présente étude pourrait représenter un test sensible pour la détection et la quantification absolue de l’ARN du VHE dans les échantillons alimentaires, avec l’avantage de présenter la co-amplification du contrôle interne du processus.